Search Thermo Fisher Scientific
효율성을 최적화하는 동시에 스크리닝 성공 가능성을 높이세요
고속대량 스크리닝은 수천 개 또는 수만 개의 화합물을 테스트하여 표적에 결합하는 "히트(hit)"를 식별하는 작업에 관여합니다. 이 프로세스는 자물쇠에 맞는 하나 이상의 열쇠를 찾기 위해 많은 열쇠를 시도하는 것과 같습니다.
Thermo Scientific Maybridge 스크리닝 컬렉션은 구조적으로 기능적으로 다양하며 잠재적으로 문제가 있는 구조를 제외하고 적합한 약동학적 특성을 나타내는 50,000개 이상의 합성 유래 유기 화합물로 구성됩니다. 개별적으로 설계된 이 화합물은 50년 이상의 헤테로고리 화학 경험을 바탕으로 Thermo Fisher Scientific에서 제조한 혁신적인 합성 기법을 사용해 제조됩니다.
스크리닝 라이브러리 선택은 초기 단계에서 저분자 약물 발견 프로그램의 성패를 좌우합니다. 저희의 스크리닝 라이브러리는 프로젝트당 비용, 시간 및 노력을 최적화하는 동시에 긍정적인 결과의 가능성을 높이도록 설계되었습니다.
사전 플레이트(Pre-plated) 고속대량 스크리닝 라이브러리
저희는 고속대량 스크리닝 HTS를 위해 인간 약물작용발생단의 다양성을 나타내는 세 가지 사전 플레이트(pre-plated) 라이브러리를 제공합니다. 세 라이브러리 모두에 있는 화합물은 "약물 유사(drug-like)" 특성을 위해 Lipinski Rule of 5(Ro5) 가이드라인을 준수합니다. 또한 공유 결합, 독성, 불용성 또는 지나치게 단순함을 보이는 반응성 화합물을 제외하여 위양성을 감소하도록 설계되었습니다.
항균성 또는 키나아제 등 특정 유형의 표적에 초점을 둔 라이브러리는 아래의 집중 스크리닝 라이브러리를 참조하십시오.
Maybridge HTS 라이브러리 비교 표
| Maybridge HitDiscover | Maybridge HitFinder | Maybridge HitCreator | |
| 제품 요약 | 완전한 Maybridge 스크리닝 컬렉션 |
다양성을 나타내는 관리 가능한 MSC 하위 집합 |
상업적으로 이용가능한 라이브러리의 탁월한 다양성 |
권장 용도 |
모든 다양한 화합물의 완전 스크리닝 |
더 쉽고 경제적이지만 여전히 다양한 스크리닝 세트 |
더욱 광범위하고 다양한 컬렉션에서 샘플링 |
| 화합물 수 | >50,000 |
14,400 | 14,000 |
| 소스 라이브러리 크기 | >50,000 화합물 |
>50,000 화합물 | >500,000 화합물 |
| 반응성 분자 제외 |
|
 |
|
| Lipinski Ro5 준수 | 대부분 |
|
|
| 사용 가능한 건조 필름 형식 |
|
|
|
| 순도 >90% | |
|
|
| 다양성 필터 적용 |
|
|
|
초점화된 HTS 스크리닝 라이브러리
외부 파트너와의 긴밀한 협력을 통해, Maybridge 컬렉션에는 생물정보학 및 구조 기반 약물 발견에 기반한 다양한 계산 방법론을 적용하여 생성된 약물 유사(drug-like) 화합물의 표적 지정 라이브러리가 포함되어 있습니다. 이러한 화합물 집중 스크리닝 라이브러리는 특정 생물학적 활동을 나타내는 새로운 화학적 개체의 발견을 용이하게 하거나 특정 분자 또는 생물학적 표적을 스크리닝하기 위해, 제공되는 컬렉션 중에서 선택할 수 있습니다. 이들은 높은 히트(hit) 비율을 보였습니다.
Maybridge 초점화된 스크리닝 라이브러리
| 라이브러리 | 화합물 수 | 선택 기준 |
| 항바이러스 | >6,000 | 심도 있는 항바이러스 작용과 개선된 안전성 프로파일을 가진 새롭고 가치있는 리드(lead) 화합물의 발견을 촉진하기 위해 선택된 저분자 및 거대고리(macrocycle) |
항박테리아 | 약 6,000 | 골격의 다양성을 제공하는 독점적인 스캐폴드(자연에서 발생하는 것과 같은)를 기반으로 하며, 극성 작용기와 여러 입체 중심의 존재와 결합되어 있습니다. |
| 단백질-단백질 상호작용(Protein-protein interactions, PPI) | >11,000 | PPI 관련 화학적 공간 분석과 빌딩 블록, 단편 및 스캐폴드의 총체적인 개발을 통해 선택하여 질병 관련 PPI를 처리합니다. |
| GPCR | >8,000 | 표적으로 하기 어려운 지질 GPCR을 비롯한 G-단백질 결합 수용체에 대한 스크리닝을 위해 선택됩니다. |
| 키나아제(Kinase) | >6,000 | 저분자, 단편 및 거대 고리의 고급 컬렉션에 대한 액세스를 제공하여 새로운 키나아제 억제제의 발견을 촉진하기 위해 선택되며, 계산기내(in silico) 모델링 및 체외(in vitro() 표적 표현형 프로파일링을 통해 화합물의 효능이 검증되었습니다 |
| 프로테아제(Protease) | >6,000 | |
| 이온 채널 | >8,000 | 전압 개폐성 칼륨, 나트륨 채널 및 T형 칼슘 채널을 포함한 알려진 이온 채널 차단제의 약물작용발생단 분석을 기반으로 합니다. |
| 후성유전학 | >5,000 | 브로모도메인 함유 단백질 및 히스톤 메틸전달효소를 포함한 후성유전 화합물 |
기타 초점화된 라이브러리(예: 히스톤 디아세틸라제 또는 HDAC 억제제에 대한 스크리닝 화합물 라이브러리)는 요청 시 이용할 수 있습니다.
Maybridge 스크리닝 컬렉션의 속성 및 프로파일
Maybridge 스크리닝 컬렉션은 시장을 선도하는 다양성과 품질로 널리 인정받고 있습니다. 화합물 검사에서 라이브러리의 크기는 "약물 유사(drug-like)" 공간에 대표 화합물을 포함하는 다양성만큼 중요하지는 않습니다. 적합한 화학적 특성을 가진 매우 다양한 화합물 라이브러리는 덜 적합한 화학적 특성을 가진 더 크고 다양하지 않은 라이브러리보다 "히트(hit)"를 발견할 가능성이 높습니다.
Maybridge 컬렉션은 복잡하고 다양한 속성을 가진 구조로 이루어져 있습니다. 의약 화학에서 Lipinski의 Rule of 5(Ro5)는 인간에서 경구 활성 가능성이 있는 화합물의 예비 측정치로서 널리 알려져 있습니다.1 Ro5는 약물 발견 시 고려해야 할 중요한 파라미터(모두 5의 배수)를 제안합니다. 여기에서, 각 파라미터에 대해 Maybridge 스크리닝 컬렉션의 계산된 분포를 제공합니다.
약물 유사(drug-like) 특성을 위한 Lipinski의 5의 법칙에 대한 Maybridge 스크리닝 컬렉션 프로파일
| Ro5 기준 | Maybridge 스크리닝 컬렉션 지표 |
| ≤ 5 수소 결합 공여체 | 99.7% ≤ 5 |
≤ 10 수소 결합 수용체 | 99.8% ≤ 10 |
| cLogP ≤ 5 | 평균 cLogP = 3.23; –0.11~6.3 범위에서 94% |
| Mol. Wt. <500 | 평균 mol. Wt. = 325, 150~500 범위에서 95% |
분자량
약물 화합물의 이상적인 분자량은 500 Dalton 미만입니다. Maybridge 스크리닝 컬렉션은 주로 이 이상적인 범위에 속하는 화합물로 구성되어 있습니다.
수소 결합 수용체
10개 이하의 수소 결합 수용체를 포함하는 화합물이 인체에서 경구 활성을 나타낼 가능성이 높습니다. 스크리닝 컬렉션의 모든 구조에는 평균 이하의 수소 결합 수용체가 있습니다.
수소 결합 공여체
최대 5개의 수소 결합 공여체를 포함하는 화합물은 인간에서 경구 활성이 더 높습니다. 스크리닝 컬렉션의 각 구조에는 5개 이하의 수소 결합 공여체가 있습니다.
분배 계수(cLogP)
계산된 분배 계수(cLogP)는 화합물의 용해도에 대한 통찰력을 제공합니다. 약물이 표적에 도달하려면 소수성 환경과 친수성 환경을 모두 탐색해야 하기 때문에 이는 중요한 고려 사항입니다. 화합물은 cLogP 값이 5보다 작아야 하며, Maybridge 스크리닝 컬렉션은 주로 이상적인 범위에 속하는 구조물로 구성되어 있습니다.
회전 가능한 결합
최대 10개의 회전 가능한 결합을 포함하는 화합물은 인체에서 경구 활성 가능성이 더 높습니다. 당사의 스크리닝 컬렉션의 90% 이상은 10개 이하의 회전가능한 결합을 포함하고 있습니다.
분배 계수(cLogP)
모든 계산은 Accelrys의 Tsar GD 버전 G.G를 사용하여 Maybridge에서 수행되었습니다(염 데이터는 무시됨). Tsar 참조 가이드의 정의는 다음과 같습니다.
- 수소 결합 수용체는 수소 결합을 형성하기 위해 단독으로 한 쌍의 전자를 받아들이는 것으로 정의됩니다. –O–, C=O, –CN, –N=, 3° 아민(sp2 제외), SH 또는 C=S.
- 수소 결합 공여체는 O-H, N-H, S-H 결합으로 정의되며, 여기서 원자가 하나의 전자 한 쌍을 기증하여 수소 결합을 형성합니다.
- cLogP는 원자의 부분 로그 P 값의 합계로 정의됩니다. (6)
- 회전가능한 결합은 단일, 비말단, 비고리 및 비아미드 결합으로 정의됩니다.
Maybridge 스크리닝 컬렉션 화합물 특성
| 특성 | Maybridge 스크리닝 컬렉션 속성 |
| 다양성 | 10개의 상용 라이브러리와 사용 가능한 화학물질 디렉토리(ACD)를 비교한 독립적인 1997년 연구는 사내에서 제작된 라이브러리 중에서 Maybridge가 가장 다양한 라이브러리를 가지고 있음을 보여주었습니다. 일원소집합(구성원이 하나인 클러스터) 및 클러스터 수가 가장 많았던 것입니다.3 |
| 폭 | World Drug Index(WDI)에 대해 맵핑할 경우, Maybridge 스크리닝 컬렉션은 40만 개의 이론적인 약물작용발생단의 약 87%를 표현하여 활성 부분 공간의 광범위한 커버리지를 나타내며 스크리닝 프로그램에 높은 영향을 줍니다. (계산은 Oxford Molecular에 의해 수행되었으며, 수소 결합 수용체 삼중체, 수소 결합 공여체, 방향 고리 중심 및 양성 질소 원자에 대해 Chem-X 정의를 사용했습니다.) |
ADME 프로파일 | Maybridge 컬렉션의 화합물은 일반적으로 우수한 ADME(흡수, 분포, 대사, 배출) 프로파일을 보여 초기 스크리닝 검사를 넘어 개발을 위한 강력한 후보물질이 되게 합니다. HIA(인간 장관 흡수) 40%에서 정상/불량 컷오프 설정.4 |
| 품질 | Maybridge 컬렉션 화합물은 핵자기 공명 분광법(NMR), 적외선 분광학(FT-IR), 액체 크로마토그래피–질량분석법(LC-MS), 고성능 액체 크로마토그래피(HPLC) 및 원소 분석을 포함한 적절한 방법론을 통한 스크리닝 화합물 분석에 기초하여 고품질을 제공합니다. 명시되지 않은 한 스크리닝 컬렉션의 순도는 90% 이상이며, 대부분의 화합물은 95%의 순도를 가지고 있습니다. 공유 결합, 독성, 용해도 또는 지나치게 단순함을 보이는 반응성 분자는 위양성 수를 줄이기 위해 배제됩니다. |
| 양적 가용성 | 일반적으로, 당사 컬렉션에서 화합물의 약 95%는 >5 mg 스톡 양으로, 90% 이상은 >50 mg 스톡 양으로, 상당한 비율은 그램 양으로 제공됩니다. 즉, 원래 검사된 화합물을 매우 높은 수준으로 재공급할 수 있습니다. 대부분의 주요 브랜드 플레이트 및 바이알 제품을 제공하지만 고객이 요청하는 경우, 고객이 제공한 플레이트 및 바이알 사용을 지원합니다. |
양적 가용성
일반적으로, 당사 컬렉션에서 화합물의 약 95%는 >5 mg 스톡 양으로, 90% 이상은 >50 mg 스톡 양으로, 상당한 비율은 그램 양으로 제공됩니다. 즉, 원래 검사된 화합물을 매우 높은 수준으로 재공급할 수 있습니다. 대부분의 주요 브랜드 플레이트 및 바이알 제품을 제공하지만 고객이 요청하는 경우, 고객이 제공한 플레이트 및 바이알 사용을 지원합니다.
1Lipinski CA, Lombardo F, Dominy BW, Feeney PJ. Experimental and computational approaches to estimate solubility and permeability in drug discovery and development settings. Adv Drug Deliv Rev. 2001; 46: 3–26. PubMed
2Viswanadhan VN, Ghose AK, Revankar GR, Robins RK. Atomic physiochemical parameters for three dimensional structure directed quantitative structure-activity relationships. 4. Additional parameters for hydrophobic and dispersive interactions and their application for an automated superposition of certain naturally occurring nucleoside antibiotics. J Chem Inf Comput. Sci. 1989, 29: 163–172. 초록
3McGregor MJ, Pallai PV. Clustering of large databases of compounds: Using the MDL “keys” as structural descriptors. J Chem Inf Comput. Sci. 1997, 37: 443–448. 초록
4Zhao YH, Le J, Abraham MH 등 Evaluation of human intestinal absorption data and subsequent derivation of a quantitative structure-activity relationship (QSAR) with the Abraham descriptors. J Pharm Sci. 2001, 90: 749–784. PubMed
5Platts HA, Abraham MH, Zhao YH, Hersey A, Ijaz L, Butina D. Correlation and prediction of a large blood-brain distribution data set—an LFER study. Eur J Med Chem. 2001, 36: 719–730. PubMed
6Crivori P, Cruciani G, Carrupt PA, Testa B. Predicting blood-brain barrier permeation from three-dimensional molecular structure. J Med Chem. 2000, 43: 2204–2216. PubMed
Maybridge HTS 라이브러리의 성공 사례
Maybridge 스크리닝 컬렉션은 많은 성공적인 단편 스크리닝 프로젝트의 소스가 되었습니다.
Olaparib 및 이의 Maybridge 컬렉션 전구체 분자. 2014년 BRCA 돌연변이 난소암 치료를 위해 FDA 승인을 받은 Olaparib(오른쪽, 상표명 Lynpartza)은 규제 승인을 받은 여러 약물 중 하나인 Maybridge 스크리닝 컬렉션(왼쪽)의 화합물을 사용하여 개발되었습니다. Olaparib은 DNA 복구에 관여하는 효소인 poly ADP ribose polymerase(PARP)의 억제제입니다. 여러 난소암, 유방암, 전립선암을 포함하는 유전성 BRCA1 또는 BRCA2 돌연변이가 있는 환자의 암 치료에 효과가 있습니다. Lynparza는 현재 BRCA 돌연변이 전이성 췌장암에 대한 "일차" 유지 치료제이며, 일부 환자의 질병 진행 또는 사망 위험을 줄여줍니다.
추가 약물 개발로 이어진 Maybridge 스크리닝 컬렉션에서 획득한 선택된 히트(hit)
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.